Análisis de secuencias. Genome browsers







Para el análisis de secuencias, búsquedas de genes, alineamientos, posición en el cromosoma, traducción a proteínas... y todo lo que se os pueda ocurrir me gustaría recomendaros estos dos navegadores. Realmente útiles y completos.

Requiere un tiempo hacerse a todas las herramientas que presentan.

Ensembl
  • Surge como un proyecto común entre el EBI (Instituto Europeo de Bioinformática) y Welcome Trust Sanger Institute para desarrollar un software capaz de mantener y automatizar la información publicada sobre los genomas de determinadas especies.
  • La principal ventaja que presenta esta web son sus tutoriales, bien explicados y muy prácticos, van paso a paso comentando cada una de las herramientas que ofrece.
UCSC Genome Bioinformatics
  • Está dirigido por el grupo de Genome Bioinformatics de la University of California Santa Cruz(UCSC). Presenta un gran número de especies y de herramientas, además de la posibilidad de localizar las secuencias de interés, bien por el nombre del gen, o por su localización en el cromosoma.
  • Como consejo, el botón derecho del ratón presenta diversas opciones (una vez que estamos sobre el punto de la secuencia que nos interesa), entre ellas Get DNA que nos mostrará la secuencia de ADN.
  • Quizá más complicado que el anterior, pero más completo.
  • En este post, puedes encontrar algunos consejos para utilizar este navegador: UCSC Genome Browser tutorial.

Ambos buscadores son muy útiles, pero se requiere un tiempo para poder manejar las herramientas de las que disponen.